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一種基于神經(jīng)網(wǎng)絡與SHAP解釋的肺癌生物標志物篩選方法

文檔序號:42169396發(fā)布日期:2025-06-13 16:25閱讀:10來源:國知局

本發(fā)明屬于生物醫(yī)學工程與人工智能交叉,具體涉及一種結合非線性機器學習模型(神經(jīng)網(wǎng)絡)與可解釋性分析(shapley?additive?explanations,?shap)的肺癌生物標志物篩選方法及系統(tǒng),用于提高肺癌早期診斷的準確性和模型可解釋性。


背景技術:

1、肺癌是全球死亡率最高的惡性腫瘤之一,早期診斷對提高治愈率至關重要?,F(xiàn)有技術中,低劑量ct(ldct)和肺活檢存在輻射風險、高成本或侵入性等問題,難以推廣。基于代謝物(如呼出氣)的非侵入性檢測方法成為研究熱點,但傳統(tǒng)統(tǒng)計模型(如火山圖)和傳統(tǒng)機器學習方法(如主成分分析,pca)在篩選生物標志物時存在以下缺陷:

2、線性假設限制:傳統(tǒng)統(tǒng)計模型無法捕捉復雜的非線性關系,導致標志物篩選不全面;

3、黑箱問題:機器學習模型(如神經(jīng)網(wǎng)絡)缺乏可解釋性,難以驗證標志物的生物學意義;

4、性能瓶頸:現(xiàn)有方法篩選的標志物組合在分類模型中準確率(auc?<?0.99)和穩(wěn)定性(方差?>?0.01)不足。


技術實現(xiàn)思路

1、為解決現(xiàn)有技術中存在的問題,本申請?zhí)峁┮环N基于神經(jīng)網(wǎng)絡與shapley解釋的肺癌生物標志物篩選方法,以滿足目前對肺癌生物標志物篩選方法的需求,該方法高精度、高可解釋性且適用于復雜生物數(shù)據(jù)的肺癌標志物篩選,具有很強的應用價值和實用性。

2、本發(fā)明采用的技術方案為:

3、本發(fā)明提供一種肺癌生物標志物篩選方法,包括以下步驟:

4、數(shù)據(jù)采集與預處理:通過熱脫附氣相色譜-質(zhì)譜(td-gc-ms)技術獲取肺癌患者與健康志愿者的呼出氣代謝物數(shù)據(jù),并對數(shù)據(jù)進行歸一化處理;

5、構建多層感知機(mlp)神經(jīng)網(wǎng)絡,輸入全部代謝物數(shù)據(jù),通過交叉熵損失函數(shù)和adam優(yōu)化器訓練模型;

6、采用shap方法解析神經(jīng)網(wǎng)絡輸出,計算各代謝物對分類結果的貢獻度,篩選貢獻度前10%的代謝物作為候選標志物;

7、模型驗證與優(yōu)化:基于篩選的標志物組合,訓練相同架構的神經(jīng)網(wǎng)絡模型,通過比對roc曲線下面積(auc)、靈敏度、特異性評估不同標志物組合的性能。

8、本發(fā)明的有益效果為:

9、高精度:通過神經(jīng)網(wǎng)絡擬合非線性關系,結合shap解釋篩選的標志物組合,使分類模型平均auc達0.991,方差低至0.007;

10、可解釋性:shap方法量化代謝物對診斷結果的影響,明確各個標志物的重要性程度;

11、高效性:篩選的標志物數(shù)量(36種)顯著少于傳統(tǒng)方法(69種),降低臨床檢測成本。



技術特征:

1.一種肺癌生物標志物篩選方法,其特征在于,包括以下步驟:

2.根據(jù)權利要求1所述的一種肺癌生物標志物篩選方法,其特征在于:所述步驟s2具體為:

3.根據(jù)權利要求2所述的一種肺癌生物標志物篩選方法,其特征在于:所述多層感知機神經(jīng)網(wǎng)絡,隱藏層激活函數(shù)為relu,輸出層激活函數(shù)為softmax,損失函數(shù)為交叉熵,優(yōu)化器為adam。

4.根據(jù)權利要求3所述的一種肺癌生物標志物篩選方法,其特征在于:所述多層感知機神經(jīng)網(wǎng)絡:


技術總結
一種基于神經(jīng)網(wǎng)絡與SHAP解釋的肺癌生物標志物篩選方法,其屬于標志物篩選的技術領域。該方法主要使用到了多層感知機(MLP)和Shapley可解釋性算法,通過TD?GC?MS技術獲取呼出氣代謝物數(shù)據(jù),使用神經(jīng)網(wǎng)絡擬合數(shù)據(jù),并利用SHAP方法篩選高貢獻度標志物。相比較于傳統(tǒng)方法,顯著提升了分類模型的預測準確率。本發(fā)明為非侵入性肺癌早期診斷提供了高精度、高穩(wěn)定性的解決方案,具有顯著的臨床價值。

技術研發(fā)人員:余雋,徐培柏,劉子匯,孟繁潤,李月,汪家奇
受保護的技術使用者:大連理工大學
技術研發(fā)日:
技術公布日:2025/6/12
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