本發(fā)明涉及微生物,涉及一種2-鹵代酸脫鹵酶及其基因、工程菌與其構(gòu)建方法和應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、公開該背景技術(shù)部分的信息僅僅旨在增加對本發(fā)明的總體背景的理解,而不必然被視為承認(rèn)或以任何形式暗示該信息構(gòu)成已經(jīng)成為本領(lǐng)域一般技術(shù)人員所公知的現(xiàn)有技術(shù)。
2、有機(jī)鹵代物可以通過非生物和生物方法進(jìn)行降解,而生物法以其高效、經(jīng)濟(jì)、環(huán)境友好等特點越來越受到重視。微生物是自然界重要的生產(chǎn)者和有機(jī)物的主要分解者,可以將各種復(fù)雜的有機(jī)物轉(zhuǎn)化為簡單的化合物,從而保持生態(tài)系統(tǒng)的良性循環(huán)。其中,降解有機(jī)鹵代物的微生物存在催化脫鹵作用的酶,這類酶被稱為脫鹵酶。2-鹵代酸脫鹵酶(ec3.8.1.x)是催化2-鹵代酸脫鹵水解形成相應(yīng)的2-羥基酸的一類水解型脫鹵酶,不僅能夠以一種低能耗途徑降解環(huán)境中的鹵代污染物,而且具有寬廣底物譜和高效催化效率,因而在環(huán)境修復(fù)中具有巨大應(yīng)用價值。目前分離獲得的2-鹵代酸脫鹵微生物已遍布于原核生物和真菌。
3、與細(xì)菌相比,絲狀真菌由于所產(chǎn)生的菌絲體容易捕捉氣相中的疏水性污染物,同時又具備耐低ph值和適應(yīng)高溫、干燥環(huán)境等特性,日益成為新的研究熱點。木霉( trichodermaspp.)屬于半知菌亞門、絲孢綱、絲孢目、叢梗孢科、木霉屬,是一種重要的多功能的絲狀真菌,是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中重要的植病生防菌株,是土壤環(huán)境中有毒物質(zhì)的降解菌株,是復(fù)合微生物有機(jī)肥和全元生物有機(jī)肥中重要的微生物菌種之一,也是工業(yè)生產(chǎn)中重要的酶和代謝產(chǎn)物的工程菌,在工農(nóng)業(yè)生產(chǎn)及環(huán)境保護(hù)領(lǐng)域都有著廣泛的應(yīng)用。但是,目前還未見有木霉降解鹵代污染物的相關(guān)報道,據(jù)發(fā)明人研究了解,基于木霉的代謝過程,其對有機(jī)鹵代物降解性能極低,因此無法用于鹵代污染物的降解。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明基于綠色木霉?( trichoderma?viride) tv-1511(已于2018年12月20日保藏于中國微生物菌種保藏管理委員會普通微生物中心,保藏地址為:北京市朝陽區(qū)北辰西路1號院3號,中國科學(xué)院微生物研究所,保藏號為:cgmcc?no.16800)的進(jìn)一步對環(huán)境修復(fù)的研究發(fā)現(xiàn)了一個新的脫鹵酶——2-鹵代酸脫鹵酶基因 tvhad1,該脫鹵酶具有良好的降解鹵化物的能力,基于此,本發(fā)明進(jìn)一步構(gòu)建了過表達(dá)2-鹵代酸脫鹵酶基因 tvhad1的木霉工程菌株,該工程菌具有良好的降解土壤中鹵化物的能力,基于上述研究成果,本發(fā)明提供一種2-鹵代酸脫鹵酶及其基因、工程菌與其構(gòu)建方法和應(yīng)用,
2、基于上述研究成果,本發(fā)明提供如下技術(shù)方案:
3、第一方面,一種2-鹵代酸脫鹵酶,如以下任一所述:
4、(a1)其由seq?id?no.4所示的氨基酸序列組成的蛋白質(zhì);
5、(a2)將(a1)經(jīng)過一個或幾個氨基酸殘基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同生物活性的由其衍生的蛋白質(zhì)。
6、第二方面,一種2-鹵代酸脫鹵酶基因,用于表達(dá)本發(fā)明第一方面所述的2-鹵代酸脫鹵酶。
7、在一些實施方案中,所述基因的cds的核苷酸序列為如下(b1)~(b3)任意一種:
8、(b1)如seq?id?no.3所示的核苷酸序列;
9、(b2)如seq?id?no.3所示的核苷酸序列經(jīng)一個或多個核苷酸的替換、缺失或插入形成的序列;
10、(b3)在嚴(yán)格條件下能夠與如(b1)或(b2)所述的核苷酸序列雜交并編碼相同功能蛋白的核苷酸序列。
11、第三方面,一種重組表達(dá)載體,含有本發(fā)明第二方面所述的2-鹵代酸脫鹵酶基因的表達(dá)載體。
12、第四方面,一種工程菌,所述工程菌能夠過表達(dá)本發(fā)明第一方面所述的2-鹵代酸脫鹵酶。
13、第五方面,一種工程菌的構(gòu)建方法,將本發(fā)明第三方面所述的重組表達(dá)載體轉(zhuǎn)入至出發(fā)菌株,使得構(gòu)建的工程菌株能夠過表達(dá)2-鹵代酸脫鹵酶。
14、第六方面,一種本發(fā)明第一方面所述的2-鹵代酸脫鹵酶或本發(fā)明第四方面所述的工程菌在環(huán)境修復(fù)中的應(yīng)用。
15、本發(fā)明的有益效果為:
16、本發(fā)明首次在綠色木霉tv-1511中克隆得到2-鹵代酸脫鹵酶基因 tvhad1,并利用表達(dá)載體和原生質(zhì)體融合的方法構(gòu)建了 tvhad1過表達(dá)的木霉工程菌株 tvhad1-oe。經(jīng)試驗證實了 tvhad1基因過表達(dá)可以增強(qiáng)綠色木霉菌降解土壤中鹵化物的能力,提高綠色木霉次級代謝產(chǎn)物的分泌。
1.一種2-鹵代酸脫鹵酶,其特征是,如以下任一所述:
2.一種2-鹵代酸脫鹵酶基因,其特征是,用于表達(dá)權(quán)利要求1所述的2-鹵代酸脫鹵酶。
3.如權(quán)利要求2所述的2-鹵代酸脫鹵酶基因,其特征是,所述基因的cds的核苷酸序列為如下(b1)~(b3)任意一種:
4.一種重組表達(dá)載體,其特征是,含有權(quán)利要求2或3所述的2-鹵代酸脫鹵酶基因的表達(dá)載體。
5.如權(quán)利要求4所述的重組表達(dá)載體,其特征是,所述的表達(dá)載體為為真菌質(zhì)粒,或,所述真菌質(zhì)粒為pbargpe1-hygro質(zhì)粒;
6.一種工程菌,其特征是,所述工程菌能夠過表達(dá)權(quán)利要求1所述的2-鹵代酸脫鹵酶。
7.如權(quán)利要求6所述的工程菌,其特征是,所述工程菌為木霉屬;或,所述工程菌為綠色木霉;或,所述工程菌為綠色木霉?(trichoderma?viride)?tv-1511,保藏號為:cgmccno.16800。
8.一種工程菌的構(gòu)建方法,其特征是,將權(quán)利要求4或5所述的重組表達(dá)載體轉(zhuǎn)入至出發(fā)菌株,使得構(gòu)建的工程菌株能夠過表達(dá)2-鹵代酸脫鹵酶;
9.一種權(quán)利要求1所述的2-鹵代酸脫鹵酶或權(quán)利要求6或7所述的工程菌在環(huán)境修復(fù)中的應(yīng)用。
10.如權(quán)利要求9所述的應(yīng)用,其特征是,所述環(huán)境修復(fù)為降解有機(jī)鹵代物;優(yōu)選地,所述有機(jī)鹵代物為含有鹵素的染料;進(jìn)一步優(yōu)選地,所述染料為溴酚藍(lán)或溴甲酚;